Protein–RNA interactions for Protein: Q14019

COTL1, Coactosin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COTL1Q14019 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COTL1Q14019 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms