Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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