Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP1Q13835 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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