Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
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