Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SP140Q13342 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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SP140Q13342 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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SP140Q13342 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SP140Q13342 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SP140Q13342 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SP140Q13342 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SP140Q13342 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SP140Q13342 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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SP140Q13342 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP140Q13342 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP140Q13342 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP140Q13342 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP140Q13342 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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SP140Q13342 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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