Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRSF6Q13247 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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