Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RLFQ13129 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RLFQ13129 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RLFQ13129 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RLFQ13129 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RLFQ13129 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RLFQ13129 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RLFQ13129 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RLFQ13129 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RLFQ13129 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RLFQ13129 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RLFQ13129 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RLFQ13129 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RLFQ13129 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RLFQ13129 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RLFQ13129 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RLFQ13129 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RLFQ13129 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RLFQ13129 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RLFQ13129 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RLFQ13129 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RLFQ13129 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RLFQ13129 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RLFQ13129 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RLFQ13129 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RLFQ13129 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RLFQ13129 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RLFQ13129 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RLFQ13129 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RLFQ13129 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RLFQ13129 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RLFQ13129 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RLFQ13129 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
RLFQ13129 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
RLFQ13129 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RLFQ13129 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RLFQ13129 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RLFQ13129 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RLFQ13129 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RLFQ13129 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RLFQ13129 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
RLFQ13129 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RLFQ13129 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RLFQ13129 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RLFQ13129 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RLFQ13129 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RLFQ13129 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RLFQ13129 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RLFQ13129 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RLFQ13129 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RLFQ13129 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RLFQ13129 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RLFQ13129 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RLFQ13129 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RLFQ13129 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RLFQ13129 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RLFQ13129 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RLFQ13129 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RLFQ13129 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RLFQ13129 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RLFQ13129 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RLFQ13129 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RLFQ13129 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RLFQ13129 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RLFQ13129 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RLFQ13129 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RLFQ13129 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RLFQ13129 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RLFQ13129 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RLFQ13129 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RLFQ13129 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RLFQ13129 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RLFQ13129 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RLFQ13129 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RLFQ13129 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RLFQ13129 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RLFQ13129 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RLFQ13129 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RLFQ13129 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RLFQ13129 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RLFQ13129 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RLFQ13129 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RLFQ13129 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RLFQ13129 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RLFQ13129 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RLFQ13129 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RLFQ13129 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RLFQ13129 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RLFQ13129 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RLFQ13129 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RLFQ13129 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RLFQ13129 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RLFQ13129 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RLFQ13129 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RLFQ13129 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RLFQ13129 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RLFQ13129 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RLFQ13129 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RLFQ13129 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RLFQ13129 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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