Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms