Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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