Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms