Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms