Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FMODQ06828 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FMODQ06828 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FMODQ06828 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms