Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms