Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CALD1Q05682 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms