Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms