Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms