Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms