Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX6P78412 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX6P78412 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX6P78412 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX6P78412 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX6P78412 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX6P78412 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX6P78412 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX6P78412 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX6P78412 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX6P78412 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX6P78412 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX6P78412 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX6P78412 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX6P78412 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX6P78412 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX6P78412 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX6P78412 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX6P78412 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX6P78412 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX6P78412 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX6P78412 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX6P78412 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX6P78412 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX6P78412 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX6P78412 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX6P78412 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX6P78412 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX6P78412 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX6P78412 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX6P78412 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX6P78412 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX6P78412 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX6P78412 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX6P78412 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX6P78412 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX6P78412 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX6P78412 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX6P78412 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX6P78412 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX6P78412 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX6P78412 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX6P78412 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX6P78412 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX6P78412 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX6P78412 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX6P78412 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX6P78412 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX6P78412 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX6P78412 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX6P78412 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX6P78412 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX6P78412 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX6P78412 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX6P78412 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX6P78412 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX6P78412 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX6P78412 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX6P78412 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX6P78412 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX6P78412 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX6P78412 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX6P78412 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX6P78412 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX6P78412 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX6P78412 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX6P78412 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms