Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HBBP68871 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms