Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms