Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB38P57729 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB38P57729 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB38P57729 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB38P57729 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB38P57729 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB38P57729 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB38P57729 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB38P57729 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB38P57729 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB38P57729 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB38P57729 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB38P57729 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB38P57729 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB38P57729 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB38P57729 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB38P57729 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB38P57729 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB38P57729 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB38P57729 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB38P57729 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB38P57729 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB38P57729 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB38P57729 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB38P57729 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB38P57729 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB38P57729 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB38P57729 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB38P57729 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB38P57729 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB38P57729 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB38P57729 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB38P57729 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB38P57729 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB38P57729 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB38P57729 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB38P57729 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB38P57729 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB38P57729 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB38P57729 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB38P57729 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB38P57729 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB38P57729 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms