Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BACE1P56817 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BACE1P56817 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BACE1P56817 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BACE1P56817 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BACE1P56817 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BACE1P56817 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BACE1P56817 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BACE1P56817 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BACE1P56817 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BACE1P56817 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BACE1P56817 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BACE1P56817 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BACE1P56817 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BACE1P56817 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BACE1P56817 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BACE1P56817 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BACE1P56817 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BACE1P56817 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BACE1P56817 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BACE1P56817 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BACE1P56817 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BACE1P56817 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BACE1P56817 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BACE1P56817 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BACE1P56817 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BACE1P56817 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BACE1P56817 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BACE1P56817 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BACE1P56817 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BACE1P56817 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BACE1P56817 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BACE1P56817 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BACE1P56817 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BACE1P56817 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BACE1P56817 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BACE1P56817 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BACE1P56817 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BACE1P56817 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BACE1P56817 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BACE1P56817 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BACE1P56817 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BACE1P56817 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BACE1P56817 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BACE1P56817 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BACE1P56817 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BACE1P56817 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BACE1P56817 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BACE1P56817 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BACE1P56817 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BACE1P56817 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BACE1P56817 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BACE1P56817 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BACE1P56817 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BACE1P56817 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BACE1P56817 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BACE1P56817 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BACE1P56817 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BACE1P56817 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BACE1P56817 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BACE1P56817 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BACE1P56817 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BACE1P56817 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BACE1P56817 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BACE1P56817 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BACE1P56817 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BACE1P56817 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BACE1P56817 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BACE1P56817 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms