Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO3P55854 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms