Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
FNTAP49354 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FNTAP49354 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FNTAP49354 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FNTAP49354 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FNTAP49354 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FNTAP49354 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FNTAP49354 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNTAP49354 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNTAP49354 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNTAP49354 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNTAP49354 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNTAP49354 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNTAP49354 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNTAP49354 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FNTAP49354 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNTAP49354 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNTAP49354 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNTAP49354 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNTAP49354 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNTAP49354 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNTAP49354 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNTAP49354 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNTAP49354 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNTAP49354 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNTAP49354 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNTAP49354 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms