Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 LRFN3-204ENST00000588831 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 TXLNA-202ENST00000373610 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 CCAR2-206ENST00000520861 3560 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 AL118505.1-201ENST00000619370 1932 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 BDNF-218ENST00000533246 4000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PCP4P48539 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PCP4P48539 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PCP4P48539 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PCP4P48539 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PCP4P48539 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PCP4P48539 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PCP4P48539 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PCP4P48539 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PCP4P48539 SHC1-210ENST00000448116 3481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PCP4P48539 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PCP4P48539 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PCP4P48539 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PCP4P48539 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PCP4P48539 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms