Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms