Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RANGAP1P46060 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms