Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3CBP42338 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms