Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPOP42166 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPOP42166 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPOP42166 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPOP42166 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPOP42166 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPOP42166 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPOP42166 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPOP42166 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPOP42166 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPOP42166 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPOP42166 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPOP42166 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPOP42166 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPOP42166 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPOP42166 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPOP42166 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPOP42166 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPOP42166 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPOP42166 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPOP42166 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPOP42166 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPOP42166 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPOP42166 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPOP42166 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPOP42166 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPOP42166 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPOP42166 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPOP42166 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPOP42166 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPOP42166 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPOP42166 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPOP42166 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPOP42166 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPOP42166 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPOP42166 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPOP42166 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPOP42166 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPOP42166 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPOP42166 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPOP42166 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPOP42166 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPOP42166 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPOP42166 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPOP42166 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMPOP42166 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPOP42166 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPOP42166 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPOP42166 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPOP42166 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPOP42166 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPOP42166 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPOP42166 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPOP42166 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPOP42166 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPOP42166 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPOP42166 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPOP42166 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPOP42166 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPOP42166 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPOP42166 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPOP42166 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPOP42166 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPOP42166 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPOP42166 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPOP42166 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPOP42166 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPOP42166 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPOP42166 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms