Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPGP40121 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPGP40121 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPGP40121 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPGP40121 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPGP40121 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPGP40121 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPGP40121 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPGP40121 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPGP40121 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPGP40121 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms