Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGCXP38435 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGCXP38435 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGCXP38435 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGCXP38435 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGCXP38435 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGCXP38435 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGCXP38435 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GGCXP38435 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGCXP38435 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGCXP38435 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGCXP38435 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGCXP38435 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGCXP38435 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGCXP38435 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGCXP38435 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGCXP38435 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGCXP38435 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGCXP38435 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGCXP38435 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGCXP38435 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGCXP38435 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGCXP38435 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGCXP38435 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGCXP38435 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GGCXP38435 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GGCXP38435 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GGCXP38435 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GGCXP38435 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GGCXP38435 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GGCXP38435 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GGCXP38435 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GGCXP38435 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GGCXP38435 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GGCXP38435 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GGCXP38435 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GGCXP38435 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GGCXP38435 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GGCXP38435 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GGCXP38435 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GGCXP38435 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GGCXP38435 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GGCXP38435 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GGCXP38435 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GGCXP38435 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GGCXP38435 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GGCXP38435 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GGCXP38435 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GGCXP38435 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GGCXP38435 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GGCXP38435 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GGCXP38435 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GGCXP38435 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GGCXP38435 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GGCXP38435 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GGCXP38435 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GGCXP38435 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GGCXP38435 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GGCXP38435 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GGCXP38435 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GGCXP38435 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GGCXP38435 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GGCXP38435 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GGCXP38435 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GGCXP38435 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GGCXP38435 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GGCXP38435 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GGCXP38435 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GGCXP38435 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GGCXP38435 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GGCXP38435 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GGCXP38435 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GGCXP38435 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GGCXP38435 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GGCXP38435 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GGCXP38435 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GGCXP38435 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GGCXP38435 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GGCXP38435 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GGCXP38435 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GGCXP38435 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GGCXP38435 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GGCXP38435 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GGCXP38435 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GGCXP38435 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GGCXP38435 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GGCXP38435 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GGCXP38435 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GGCXP38435 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GGCXP38435 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GGCXP38435 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GGCXP38435 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GGCXP38435 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GGCXP38435 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GGCXP38435 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GGCXP38435 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GGCXP38435 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GGCXP38435 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GGCXP38435 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GGCXP38435 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms