Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms