Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms