Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LAMA1P25391 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms