Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BGNP21810 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BGNP21810 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BGNP21810 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BGNP21810 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BGNP21810 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BGNP21810 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BGNP21810 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BGNP21810 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BGNP21810 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BGNP21810 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BGNP21810 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BGNP21810 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BGNP21810 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BGNP21810 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BGNP21810 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BGNP21810 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BGNP21810 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BGNP21810 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BGNP21810 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BGNP21810 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BGNP21810 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BGNP21810 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BGNP21810 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BGNP21810 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BGNP21810 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BGNP21810 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BGNP21810 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BGNP21810 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BGNP21810 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BGNP21810 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BGNP21810 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BGNP21810 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BGNP21810 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BGNP21810 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BGNP21810 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BGNP21810 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BGNP21810 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BGNP21810 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BGNP21810 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BGNP21810 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BGNP21810 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BGNP21810 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BGNP21810 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BGNP21810 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BGNP21810 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BGNP21810 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BGNP21810 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BGNP21810 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BGNP21810 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BGNP21810 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BGNP21810 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BGNP21810 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BGNP21810 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BGNP21810 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BGNP21810 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BGNP21810 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BGNP21810 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BGNP21810 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BGNP21810 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms