Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A1P19634 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A1P19634 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A1P19634 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A1P19634 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A1P19634 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A1P19634 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A1P19634 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A1P19634 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A1P19634 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A1P19634 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A1P19634 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A1P19634 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A1P19634 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A1P19634 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A1P19634 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A1P19634 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A1P19634 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A1P19634 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A1P19634 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A1P19634 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A1P19634 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A1P19634 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A1P19634 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A1P19634 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A1P19634 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A1P19634 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A1P19634 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A1P19634 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A1P19634 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A1P19634 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC9A1P19634 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC9A1P19634 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms