Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PDGFRAP16234 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms