Protein–RNA interactions for Protein: O43543

XRCC2, DNA repair protein XRCC2, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC2O43543 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
XRCC2O43543 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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