Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNMO15061 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNMO15061 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNMO15061 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNMO15061 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNMO15061 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNMO15061 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNMO15061 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNMO15061 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNMO15061 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNMO15061 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNMO15061 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNMO15061 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNMO15061 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNMO15061 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNMO15061 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNMO15061 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNMO15061 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNMO15061 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNMO15061 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNMO15061 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNMO15061 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNMO15061 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNMO15061 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNMO15061 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNMO15061 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNMO15061 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNMO15061 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNMO15061 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNMO15061 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNMO15061 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNMO15061 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNMO15061 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNMO15061 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNMO15061 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNMO15061 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNMO15061 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNMO15061 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNMO15061 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNMO15061 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNMO15061 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNMO15061 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNMO15061 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNMO15061 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNMO15061 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNMO15061 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNMO15061 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNMO15061 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNMO15061 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNMO15061 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNMO15061 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNMO15061 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNMO15061 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNMO15061 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNMO15061 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNMO15061 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNMO15061 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNMO15061 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNMO15061 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNMO15061 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNMO15061 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNMO15061 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNMO15061 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNMO15061 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNMO15061 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNMO15061 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNMO15061 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNMO15061 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNMO15061 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNMO15061 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNMO15061 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNMO15061 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNMO15061 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNMO15061 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNMO15061 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNMO15061 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNMO15061 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNMO15061 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNMO15061 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNMO15061 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNMO15061 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNMO15061 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNMO15061 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNMO15061 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNMO15061 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNMO15061 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNMO15061 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNMO15061 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNMO15061 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNMO15061 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNMO15061 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNMO15061 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNMO15061 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNMO15061 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNMO15061 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNMO15061 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNMO15061 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNMO15061 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNMO15061 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNMO15061 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms