Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF879B4DU55 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms