Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISM1B1AKI9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms