Protein–RNA interactions for Protein: A6NJ08

MBD3L5, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L5A6NJ08 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MBD3L5A6NJ08 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MBD3L5A6NJ08 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms