Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms