Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms