Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms