Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ8

DOLK, Dolichol kinase, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DOLKQ9UPQ8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DOLKQ9UPQ8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms