Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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RABGEF1Q9UJ41 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
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RABGEF1Q9UJ41 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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RABGEF1Q9UJ41 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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RABGEF1Q9UJ41 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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RABGEF1Q9UJ41 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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RABGEF1Q9UJ41 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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RABGEF1Q9UJ41 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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RABGEF1Q9UJ41 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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RABGEF1Q9UJ41 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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RABGEF1Q9UJ41 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGEF1Q9UJ41 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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