Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms