Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC88CQ9P219 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms