Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCIQ9NVI1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms